Меморіальний музей пам’яті жертв Бабиного Яру як складова частина Національного історико–меморіального заповідника «Бабин Яр» буде державною науково–дослідною, культурно–освітньою та науково–методичною установою. Основним завданням Музею стане збір, зберігання і демонстрація матеріалів про трагічні події, що відбувалися на території урочища Бабин Яр у ХХ ст. Музей стане центром, який акумулює краєзнавчі та історичні дослідження, присвячені передумовам і перебігу подій, їх жертвам, винуватцям і співучасникам, їх наслідкам та історичним урокам, їх забуттю, пам’яті та меморіалізації цього фатального місця.
Сьогодні фахівці–музейники розрізняють консервативний і прогресивний типи музеїв. Музей прогресивного типу – це не просто колекція, створена відповідно до універсальних (а тому – невиразних) методик. Сучасний музей, а тим більше музей такої трагічної теми, як Бабин Яр, – це водночас інтелектуальний і сакральний простір, призначений не лише для інформаційного та загальнокультурного впливу на відвідувачів, а й здатний справляти на них значний духовний вплив. У цьому ми бачимо сенс і мету Музею.
Експозиції та виставкові проекти мають дати відвідувачам розуміння умов і обставин життя Києва у різні історичні періоди, усвідомлення того, який ідеологічний і силовий вплив відчували городяни, як цей вплив позначився на їхній ментальності та на поведінці в критичних ситуаціях. Слід показати причини і мотиви взаємин між різними групами населення, між групами населення і владою. Мають бути виділені та продемонстровані випадки особистого і групового опору насильству, виступів проти нелюдських акцій, подвиги самопожертви і порятунку невинних жертв.
Однією з найважливіших цілей діяльності Музею має бути боротьба зі стереотипами сприйняття трагедій Бабиного Яру. Потрібно показувати взаємозв’язок між різними трагедіями, пояснювати, як масові жертви ставали фактором зміни історичної свідомості сучасників і нових поколінь. Не можна уникати складних, суперечливих, конфліктних тем. Усі сторони й обставини трагічних подій мають бути висвітлені в експозиції та в науковій діяльності Музею.
Вагомою частиною експозиції будуть записи спогадів свідків та жертв трагедій Бабиного Яру, демонстрація артефактів і особистих документів, використання творів літератури та мистецтва, присвячених трагедії Бабиного Яру.